一、基因敲降的前期准备工作相同1.1 生物信息学分析目标基因在斑马鱼早期胚胎发送过程中是否有表达。1.2 收集斑马鱼早期发育胚胎(通常为48 hpf 前的胚胎),提取总RNA,然后进行体外转录(RT)。1.3 设计检测目标基因表达的PCR 引物,以1.2获得的cDNA 为模板,进行PCR 扩增,确认目标基因在早期有表达。二、MO法与CRISPRi法的敲降原理不同2.1 MO 是在转录后水平上敲降基
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一般推荐MO+CRISPRi两种策略去同时敲降一个基因,由于MO是在转录后水平上敲降基因的功能,而CRISPRi是在转录水平上敲降基因的功能,使用两种独立的、原理完全不同的敲降方法,如果给出的敲降效果(表型)是一样的,那么这样建立的敲降方法可以被认可是有效且特异的。请大家注意:评价基因敲降效果需要从有效和特异两个方面来考虑。有效性问题:CRISPRi敲降的有效性可以通过RT-PCR法检测目标基因表
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